-前処理・抽出・分画・極微量定量・動態解析まで一貫対応。実検体ダイナミクスを“局在情報を保持したまま”定量化 -

株式会社BioPhenoMA（東京都新宿区、代表取締役社長：丹羽 大介）は、独自の極微量タンパク質定量技術「TN-cyclon(TM)」を基盤とし、血液・尿・唾液・喀痰など多様な実検体を対象とした タンパク質解析の受託研究サービス を本格的に開始しました。本サービスは、前処理・抽出・分画・抗体選定・測定系構築から、0.1 pg/mLレベルの高感度定量、さらに動態解析や局在情報の解釈までを一貫して提供するものです。

本サービスは 研究目的に限定 されており、臨床診断・治療判断には利用できません。また、ヒト由来検体の受け入れにあたっては、感染性区分や取り扱い区分に応じて事前確認を行います。

■ 背景：実検体で分子動態を捉えることが研究のボトルネックに
がん、神経変性疾患、感染症、代謝疾患などの研究領域では、病態の初期変化や刺激応答を 実検体で直接評価する ことが求められています。しかし従来技術には、以下のような根本的な限界がありました。
抽出工程で構造情報が失われ、エクソソーム等の膜側／内腔側の区別が消える 均質化により局在差が評価できない 微量タンパク質は従来ELISAではノイズに埋もれる 非侵襲検体では特に感度不足が顕著
その結果、研究者は「実検体をどう扱えば測定可能になるのか」という前処理・分画・抗体選定の最適化に多大な時間を費やし、研究の進展が阻害されてきました。
BioPhenoMAは、国内外の共同研究で蓄積した知見をもとに、実検体解析に必要な前処理・分画・極微量定量・動態解析を体系化し、実検体を“測れる状態”に導く統合ワークフロー を確立しました。

■ サービス概要：実検体で「測れる状態」をつくる一貫支援
BioPhenoMAの受託研究サービスは、単なる測定代行ではなく、
“From sample to mechanism（検体からメカニズムへ）” を実現する現象解明型の研究支援です。

● 検体前処理
血液・尿・唾液・喀痰など、構造物を含む実検体に応じた最適化を実施。
● エクソソーム抽出
生体試料からエクソソームを含む目的画分を適切に抽出。
● 分画（局在情報保持）
分画工程ではエクソソーム構造体そのものは破壊されますが、
膜画分／内腔画分を分離することで、標的タンパク質がどちらに局在していたかという“局在情報”を保持したまま解析可能 です。
● 極微量定量（TN‑cyclon(TM)）
0.1 pg/mLレベルの超高感度測定を一般ラボ設備で実現。
● 動態解析
刺激条件・処理条件・経時変化など、研究用検体における分子動態を定量的に評価。
● 局在差・メカニズム解釈
膜側／内腔側の局在差、刺激応答、病態進行などの分子機構を読み解く解析支援。

■ どんな研究に使えるのか
BioPhenoMAの受託研究サービスは、以下のような研究課題に特に有効です。

● 薬剤刺激・処理条件に伴うタンパク質動態の解析
細胞・モデル動物・研究用検体における時間変化を定量。
● エクソソーム膜／内腔の局在差の解明
疾患関連タンパク質が膜側か内腔側かを極微量レベルで判別。
● 非侵襲検体による早期指標探索
尿・唾液中のサブpg/mLタンパク質の変動を検出。
● 質量分析で得た候補マーカーの“実検体での”妥当性検証
実際の研究用検体で変動するかを確認。
● 細胞ストレスや薬剤刺激に伴うタンパク質の変化解析
ストレス条件で細胞が放出するタンパク質の変化を追跡。

図：動態解析の具体例
https://doi.org/10.1016/j.ab.2022.114831
このように、実検体ベースで分子動態を追跡できる点 が本サービスの大きな特長です。

■ 研究目的に応じた柔軟な対応
● 新規マーカー探索
抗体探索、マッチドペア抗体の選定、前処理条件検討、測定系構築まで包括的に支援。
● 既存マーカーの深掘り
複数マーカーの挙動解析、エクソソーム分画測定、実検体での再評価に対応。
● 非侵襲検体の活用
尿・唾液などを用いた新規指標探索にも対応。

■ 研究用試薬キットとの連動
BioPhenoMAが提供する「TN-cyclon(TM) ELISA 開発キット」や「PD-L1 TN-cyclon(TM) ELISA キット」を利用している研究者は、キットで得られた知見をそのまま研究用途の受託研究へ発展させることができます。技術相談やプロトコール検討も含め、研究の次のステップへスムーズに移行できる体制を整えています。

■ 今後の展望
BioPhenoMAは、実検体解析に必要な前処理・分画・高感度定量・動態解析を統合した次世代の研究基盤の開発を進めており、今後の発表を予定しています。
また、2026年4月に米国プエルトリコで開催される国際細胞外小胞学会（ISEV2026）において、早稲田大学と共同でTN-cyclon(TM)を用いた研究成果を発表する予定です。国際的な学術発表を通じて技術の妥当性と認知をさらに高め、実検体解析に取り組む研究者との連携を一層強化してまいります。

■ 会社概要
BioPhenoMAは早稲田大学　伊藤悦朗教授らが開発した、極微量タンパク質検出技術「TN-cyclon(TM)」を有するスタートアップです。「TN-cyclon(TM)」は一般的なバイオラボの設備を用いて、血中やエクソソームに含まれる極微量タンパク質を超高感度に測定できる技術です。
弊社は生体現象機構を解析するために“誰もがどこでも簡単に「極微量タンパク質検出」を行える革新的なプラットフォームを創生し、生物医学分野の更なる進歩に貢献する”をミッションとして掲げて、研究開発を推進しております。

株式会社BioPhenoMA
設立：2023年4月18日
住所：東京都新宿区西早稲田1-22-3
代表取締役：丹羽　大介
HP：https://www.biophenoma.com/
E-mail：info@biophenoma.com

BioPhenoMA Launches Full-Scale Contract Research Service Enabling Protein Dynamics Analysis Using Real-World Biological Samples
- A unified workflow covering sample preparation, fractionation, ultrasensitive quantification, and dynamics interpretation -

BioPhenoMA Inc. (Shinjuku, Tokyo; CEO: Daisuke Niwa) today announced the full-scale launch of its Contract Research Service designed to quantify protein dynamics in real-world biological specimens. Built on the company’s proprietary ultrasensitive protein detection technology, TN-cyclon(TM), the service provides an end‑to‑end workflow-from sample preparation and fractionation to 0.1 pg/mL‑level quantification and mechanistic interpretation.
This service is strictly intended for research use only and cannot be used for clinical diagnosis or therapeutic decision-making. Acceptance of human-derived samples is subject to prior confirmation based on biosafety classification.

Background: The unmet need for dynamics analysis in real biological samples
Across oncology, neurodegeneration, infectious diseases, and metabolic disorders, researchers increasingly seek to evaluate early molecular changes and stimulus responses directly in biological specimens. However, conventional technologies face fundamental limitations:
Extraction steps eliminate structural information, removing distinctions such as membrane‑facing versus lumen‑facing components in exosomes. Membrane vs. lumenal protein distribution cannot be assessed Sub‑pg/mL proteins are undetectable with standard ELISA Sensitivity limitations are especially severe in non-invasive samples such as urine or saliva
As a result, researchers often spend significant time optimizing sample handling, fractionation, and antibody selection-slowing scientific progress.
Leveraging insights from domestic and international collaborations, BioPhenoMA has established an integrated workflow that reliably converts real-world specimens into a “measurable state,” enabling localization‑preserved, ultrasensitive, and dynamic protein analysis.

Service Overview: From Sample to Mechanism
BioPhenoMA’s Contract Research Service is not a simple measurement outsourcing solution.
It is a mechanism-oriented research support platform designed to reveal biological dynamics.

● Sample Preparation
Optimized protocols for blood, urine, saliva, sputum, and other complex specimens.
● Exosome Extraction
Appropriate isolation of exosome-containing fractions from biological samples.
● Localization-Preserved Fractionation
Although exosome structures are disrupted during fractionation,
membrane and lumen fractions are separated, allowing researchers to determine where target proteins were originally localized.
● Ultrasensitive Quantification (TN-cyclon(TM))
General laboratory equipment can achieve 0.1 pg/mL detection sensitivity.
● Dynamics Analysis
Quantitative evaluation of time-course changes under stimulation, treatment, or stress conditions.
● Mechanistic Interpretation
Support for interpreting membrane/lumen localization differences, stimulus responses, and disease progression mechanisms.

Applications
BioPhenoMA’s service is particularly effective for:
Drug‑induced protein dynamics in cells, model animals, or research specimens Exosome membrane vs. lumen localization analysis of disease‑related proteins Early biomarker discovery using non-invasive samples (urine, saliva) Validation of proteomics‑identified candidates in real specimensStress‑ or treatment‑induced protein release profiling

Example: Analysis of GRP78 dynamics in exosomes
(https://doi.org/10.1016/j.ab.2022.114831)

Flexible Support for Research Objectives
● Novel biomarker discovery
Antibody screening, matched-pair antibody selection, sample preparation optimization, and assay development.
● Deep characterization of existing markers
Multi-marker dynamics, exosome fractionation, and real-sample validation.
● Non-invasive biomarker development
Support for urine- and saliva-based exploratory studies.
Integration with Research-Use Kits
Researchers using BioPhenoMA’s TN-cyclon(TM) ELISA Development Kit or PD‑L1 TN-cyclon(TM) ELISA Kit can seamlessly extend their findings into contract research projects. Technical consultation and protocol refinement are also available.

Future Outlook
BioPhenoMA is advancing the development of next-generation research infrastructure that integrates sample preparation, fractionation, ultrasensitive quantification, and dynamics analysis.
In April 2026, the company will present joint research with WASEDA University at ISEV2026 (Puerto Rico, USA), further strengthening global recognition of TN-cyclon(TM) and expanding collaborations with researchers working on real-world specimen analysis.

About BioPhenoMA Inc.
BioPhenoMA is a biotechnology startup originating from Waseda University, founded on the ultrasensitive protein detection technology TN‑cyclon(TM), developed by Professor Etsuro Ito and colleagues. TN‑cyclon(TM) enables sub‑pg/mL quantification of proteins in blood and exosomes using standard laboratory equipment.
Our mission is to create a platform that allows anyone, anywhere, to easily detect trace proteins, accelerating scientific discovery in the life sciences.

Company Information
BioPhenoMA Inc.
Founded: April 18, 2023
Address: 1‑22‑3 Nishiwaseda, Shinjuku-ku, Tokyo
CEO: Daisuke Niwa
Website: https://www.biophenoma.com
Email: info@biophenoma.com

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